MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 37029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014220	ACT	2	6	118	123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616215
2	NC_014220	ACA	2	6	223	228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616215
3	NC_014220	GTA	2	6	417	422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616215
4	NC_014220	TGC	2	6	446	451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616215
5	NC_014220	CGG	2	6	506	511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616215
6	NC_014220	CTT	2	6	574	579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616215
7	NC_014220	CAG	2	6	649	654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616215
8	NC_014220	GAC	2	6	696	701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616215
9	NC_014220	AAG	2	6	733	738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616215
10	NC_014220	T	6	6	741	746	0 %	100 %	0 %	0 %	297616215
11	NC_014220	CA	3	6	747	752	50 %	0 %	0 %	50 %	297616215
12	NC_014220	AACA	2	8	774	781	75 %	0 %	0 %	25 %	297616215
13	NC_014220	TTA	2	6	862	867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616215
14	NC_014220	A	7	7	914	920	100 %	0 %	0 %	0 %	297616215
15	NC_014220	ATG	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616215
16	NC_014220	CATA	2	8	961	968	50 %	25 %	0 %	25 %	297616215
17	NC_014220	TA	3	6	975	980	50 %	50 %	0 %	0 %	297616215
18	NC_014220	TTG	2	6	1021	1026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616215
19	NC_014220	AT	3	6	1036	1041	50 %	50 %	0 %	0 %	297616215
20	NC_014220	CCAA	2	8	1042	1049	50 %	0 %	0 %	50 %	297616215
21	NC_014220	AGA	3	9	1166	1174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616215
22	NC_014220	CGG	2	6	1188	1193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616215
23	NC_014220	CAT	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616215
24	NC_014220	CAC	2	6	1298	1303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616215
25	NC_014220	A	6	6	1321	1326	100 %	0 %	0 %	0 %	297616215
26	NC_014220	TCT	2	6	1329	1334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616215
27	NC_014220	TTA	2	6	1356	1361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616215
28	NC_014220	TGC	2	6	1587	1592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616216
29	NC_014220	AG	3	6	1601	1606	50 %	0 %	50 %	0 %	297616216
30	NC_014220	TTCT	2	8	1634	1641	0 %	75 %	0 %	25 %	297616216
31	NC_014220	ACT	2	6	1666	1671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616216
32	NC_014220	AGA	2	6	1740	1745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616216
33	NC_014220	GAC	2	6	1825	1830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616216
34	NC_014220	GTC	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616216
35	NC_014220	A	6	6	1949	1954	100 %	0 %	0 %	0 %	297616216
36	NC_014220	CCT	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616216
37	NC_014220	GTT	2	6	2028	2033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616216
38	NC_014220	GTA	2	6	2059	2064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616216
39	NC_014220	ATG	2	6	2089	2094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616216
40	NC_014220	TCT	2	6	2107	2112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616216
41	NC_014220	AGA	2	6	2178	2183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616216
42	NC_014220	AAG	2	6	2489	2494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616216
43	NC_014220	TTTC	2	8	2537	2544	0 %	75 %	0 %	25 %	297616216
44	NC_014220	CCT	2	6	2556	2561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616216
45	NC_014220	T	6	6	2743	2748	0 %	100 %	0 %	0 %	297616217
46	NC_014220	GT	3	6	2763	2768	0 %	50 %	50 %	0 %	297616217
47	NC_014220	AAAC	2	8	2822	2829	75 %	0 %	0 %	25 %	297616217
48	NC_014220	GCC	2	6	2906	2911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616217
49	NC_014220	TTAC	2	8	2933	2940	25 %	50 %	0 %	25 %	297616217
50	NC_014220	TGA	2	6	2946	2951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616217
51	NC_014220	ATT	2	6	2959	2964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616217
52	NC_014220	AGC	2	6	2969	2974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616217
53	NC_014220	AG	3	6	2982	2987	50 %	0 %	50 %	0 %	297616217
54	NC_014220	AAC	2	6	3010	3015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616217
55	NC_014220	GCT	2	6	3022	3027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616217
56	NC_014220	CGT	2	6	3054	3059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616217
57	NC_014220	AGA	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616217
58	NC_014220	CGG	2	6	3106	3111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616217
59	NC_014220	A	7	7	3175	3181	100 %	0 %	0 %	0 %	297616217
60	NC_014220	TAC	2	6	3242	3247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616217
61	NC_014220	TGC	2	6	3300	3305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616217
62	NC_014220	AGA	2	6	3357	3362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616217
63	NC_014220	GTAT	2	8	3375	3382	25 %	50 %	25 %	0 %	297616217
64	NC_014220	CG	3	6	3540	3545	0 %	0 %	50 %	50 %	297616217
65	NC_014220	GGA	2	6	3683	3688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616217
66	NC_014220	GCA	2	6	3708	3713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616217
67	NC_014220	AGA	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616217
68	NC_014220	GTA	2	6	3757	3762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616217
69	NC_014220	GAG	2	6	3808	3813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616217
70	NC_014220	A	6	6	3821	3826	100 %	0 %	0 %	0 %	297616217
71	NC_014220	ATA	2	6	3922	3927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616218
72	NC_014220	A	8	8	3944	3951	100 %	0 %	0 %	0 %	297616218
73	NC_014220	ATA	2	6	3991	3996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616218
74	NC_014220	TTC	2	6	4026	4031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616218
75	NC_014220	AGG	3	9	4065	4073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616218
76	NC_014220	TCT	2	6	4074	4079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616218
77	NC_014220	AAGA	2	8	4154	4161	75 %	0 %	25 %	0 %	297616219
78	NC_014220	TA	3	6	4173	4178	50 %	50 %	0 %	0 %	297616219
79	NC_014220	CG	3	6	4192	4197	0 %	0 %	50 %	50 %	297616219
80	NC_014220	CAC	2	6	4203	4208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616219
81	NC_014220	ACA	2	6	4228	4233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616219
82	NC_014220	TGA	2	6	4262	4267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616219
83	NC_014220	TTA	2	6	4276	4281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616219
84	NC_014220	TACCGT	2	12	4295	4306	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	297616219
85	NC_014220	GAC	2	6	4379	4384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616219
86	NC_014220	ACTCC	2	10	4385	4394	20 %	20 %	0 %	60 %	297616219
87	NC_014220	G	6	6	4407	4412	0 %	0 %	100 %	0 %	297616219
88	NC_014220	GTG	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616219
89	NC_014220	ATC	2	6	4516	4521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616219
90	NC_014220	AAC	2	6	4577	4582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616219
91	NC_014220	CCCGGA	2	12	4604	4615	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	297616219
92	NC_014220	ATA	2	6	4647	4652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616219
93	NC_014220	GGA	2	6	4749	4754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616219
94	NC_014220	AT	3	6	4812	4817	50 %	50 %	0 %	0 %	297616219
95	NC_014220	AAG	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616219
96	NC_014220	TCCTA	2	10	4888	4897	20 %	40 %	0 %	40 %	297616219
97	NC_014220	CAA	2	6	4901	4906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616219
98	NC_014220	AGGA	2	8	4918	4925	50 %	0 %	50 %	0 %	297616219
99	NC_014220	GGT	2	6	4964	4969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616219
100	NC_014220	CCAAA	2	10	5093	5102	60 %	0 %	0 %	40 %	297616219
101	NC_014220	T	7	7	5168	5174	0 %	100 %	0 %	0 %	297616219
102	NC_014220	A	7	7	5196	5202	100 %	0 %	0 %	0 %	297616219
103	NC_014220	GCG	2	6	5220	5225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616219
104	NC_014220	CGG	2	6	5226	5231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616219
105	NC_014220	AGC	2	6	5240	5245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616219
106	NC_014220	AACT	2	8	5260	5267	50 %	25 %	0 %	25 %	297616219
107	NC_014220	AGAA	2	8	5271	5278	75 %	0 %	25 %	0 %	297616219
108	NC_014220	CCG	2	6	5371	5376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616219
109	NC_014220	ATAA	2	8	5541	5548	75 %	25 %	0 %	0 %	297616219
110	NC_014220	ACC	2	6	5557	5562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616219
111	NC_014220	TTA	2	6	5566	5571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616219
112	NC_014220	TGAC	2	8	5575	5582	25 %	25 %	25 %	25 %	297616219
113	NC_014220	TTG	2	6	5613	5618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616219
114	NC_014220	TTC	2	6	5625	5630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616219
115	NC_014220	TACGTT	2	12	5664	5675	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	297616219
116	NC_014220	GCC	2	6	5681	5686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616219
117	NC_014220	AAG	2	6	5710	5715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616219
118	NC_014220	AAG	2	6	5772	5777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616219
119	NC_014220	GA	3	6	5806	5811	50 %	0 %	50 %	0 %	297616219
120	NC_014220	GCT	2	6	5861	5866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616219
121	NC_014220	CG	3	6	5963	5968	0 %	0 %	50 %	50 %	297616219
122	NC_014220	AGAA	2	8	6265	6272	75 %	0 %	25 %	0 %	297616220
123	NC_014220	ACT	2	6	6292	6297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616220
124	NC_014220	TCG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616220
125	NC_014220	TGG	2	6	6430	6435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616220
126	NC_014220	CGATG	2	10	6482	6491	20 %	20 %	40 %	20 %	297616220
127	NC_014220	ATG	2	6	6670	6675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616220
128	NC_014220	GTA	2	6	6693	6698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616220
129	NC_014220	CTA	2	6	6720	6725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616220
130	NC_014220	CA	3	6	6775	6780	50 %	0 %	0 %	50 %	297616220
131	NC_014220	TTG	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616220
132	NC_014220	AGA	2	6	6968	6973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616220
133	NC_014220	AAAG	2	8	6974	6981	75 %	0 %	25 %	0 %	297616220
134	NC_014220	TTG	2	6	6997	7002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616220
135	NC_014220	TGG	2	6	7039	7044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616220
136	NC_014220	AGG	2	6	7143	7148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616220
137	NC_014220	TGG	2	6	7231	7236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616220
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253	NC_014220	GGAA	2	8	13447	13454	50 %	0 %	50 %	0 %	297616225
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263	NC_014220	CTC	2	6	14216	14221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616225
264	NC_014220	TTA	2	6	14520	14525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616225
265	NC_014220	T	7	7	15417	15423	0 %	100 %	0 %	0 %	297616226
266	NC_014220	TCA	2	6	15475	15480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616226
267	NC_014220	ATA	2	6	15524	15529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616226
268	NC_014220	A	6	6	15552	15557	100 %	0 %	0 %	0 %	297616226
269	NC_014220	AG	3	6	15597	15602	50 %	0 %	50 %	0 %	297616226
270	NC_014220	TG	3	6	15672	15677	0 %	50 %	50 %	0 %	297616226
271	NC_014220	AAG	2	6	15704	15709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616226
272	NC_014220	G	6	6	15746	15751	0 %	0 %	100 %	0 %	297616226
273	NC_014220	TAA	2	6	15756	15761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616226
274	NC_014220	TCA	2	6	16206	16211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616227
275	NC_014220	CTT	2	6	16277	16282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616227
276	NC_014220	ATG	2	6	16362	16367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616227
277	NC_014220	TCC	2	6	16585	16590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616228
278	NC_014220	AGCC	2	8	16604	16611	25 %	0 %	25 %	50 %	297616228
279	NC_014220	ATC	2	6	16650	16655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616228
280	NC_014220	CCA	2	6	16660	16665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616228
281	NC_014220	GGA	2	6	16687	16692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616228
282	NC_014220	GCA	2	6	16693	16698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616228
283	NC_014220	CTT	2	6	16721	16726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616228
284	NC_014220	AGA	2	6	18398	18403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616229
285	NC_014220	GCA	2	6	18479	18484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616229
286	NC_014220	TAT	2	6	18495	18500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616229
287	NC_014220	CAC	2	6	18672	18677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616229
288	NC_014220	ATG	2	6	18685	18690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616229
289	NC_014220	AGA	2	6	18719	18724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616229
290	NC_014220	ATA	2	6	18744	18749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616229
291	NC_014220	TTA	2	6	18775	18780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616229
292	NC_014220	TGT	2	6	18799	18804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616229
293	NC_014220	ATG	2	6	18982	18987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616229
294	NC_014220	ATG	2	6	19180	19185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616229
295	NC_014220	A	7	7	19220	19226	100 %	0 %	0 %	0 %	297616229
296	NC_014220	A	6	6	19260	19265	100 %	0 %	0 %	0 %	297616229
297	NC_014220	TGA	2	6	19273	19278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616229
298	NC_014220	GGA	2	6	19280	19285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616229
299	NC_014220	GGC	2	6	19319	19324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616229
300	NC_014220	CGG	2	6	19327	19332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616229
301	NC_014220	CAT	2	6	19338	19343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616229
302	NC_014220	GAAA	2	8	19502	19509	75 %	0 %	25 %	0 %	297616229
303	NC_014220	CGA	2	6	19786	19791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616230
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307	NC_014220	GAA	2	6	19928	19933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616230
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312	NC_014220	TCG	2	6	20531	20536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616231
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322	NC_014220	TCT	2	6	20979	20984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616231
323	NC_014220	GCC	2	6	21106	21111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616231
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331	NC_014220	GTCT	2	8	21493	21500	0 %	50 %	25 %	25 %	297616232
332	NC_014220	ATG	2	6	21565	21570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616232
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340	NC_014220	GCT	2	6	21995	22000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616232
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343	NC_014220	AGGT	2	8	22036	22043	25 %	25 %	50 %	0 %	297616232
344	NC_014220	A	6	6	22049	22054	100 %	0 %	0 %	0 %	297616232
345	NC_014220	GTG	2	6	22086	22091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616232
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349	NC_014220	AT	4	8	22316	22323	50 %	50 %	0 %	0 %	297616232
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352	NC_014220	ACG	2	6	22824	22829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616233
353	NC_014220	ACT	2	6	22859	22864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616233
354	NC_014220	CCAGG	2	10	22891	22900	20 %	0 %	40 %	40 %	297616233
355	NC_014220	GGC	2	6	22913	22918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616233
356	NC_014220	A	6	6	22979	22984	100 %	0 %	0 %	0 %	297616233
357	NC_014220	TCA	2	6	23052	23057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616233
358	NC_014220	CTA	2	6	23115	23120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616233
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373	NC_014220	CTGG	2	8	24152	24159	0 %	25 %	50 %	25 %	297616234
374	NC_014220	TCC	2	6	24162	24167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616234
375	NC_014220	CAG	2	6	24182	24187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616234
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377	NC_014220	ATG	2	6	24231	24236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616234
378	NC_014220	CGG	2	6	24237	24242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616234
379	NC_014220	AGT	2	6	24260	24265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616234
380	NC_014220	GAG	2	6	24281	24286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616234
381	NC_014220	GCCC	2	8	24306	24313	0 %	0 %	25 %	75 %	297616234
382	NC_014220	GCC	2	6	24322	24327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616234
383	NC_014220	GCC	2	6	24335	24340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616234
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385	NC_014220	TCC	2	6	24420	24425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616234
386	NC_014220	AGG	2	6	24442	24447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616234
387	NC_014220	CAG	2	6	24455	24460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616234
388	NC_014220	TCT	2	6	24495	24500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616234
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390	NC_014220	CAG	2	6	24694	24699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616234
391	NC_014220	AG	3	6	24756	24761	50 %	0 %	50 %	0 %	297616234
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500	NC_014220	T	7	7	32325	32331	0 %	100 %	0 %	0 %	297616239

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